Publicado originalmente por MIT Technology Review
Um consórcio público-privado lançou uma enorme coleção de perfis de células baseados em imagens.
Um dos primeiros estágios no processo de identificação de uma nova droga em potencial é expor as células ao composto em uma placa de laboratório e vasculhar as imagens do microscópio para ver os efeitos. Os biólogos que fazem esse trabalho tendem a se concentrar em algumas características selecionadas que podem indicar que a droga está funcionando – um aglomerado de proteínas marcadas com fluorescência, por exemplo, ou uma diminuição no número de células em divisão. A estratégia é tediosa e demorada, e muitas vezes falha porque os pesquisadores não têm certeza do que procurar ou onde procurar na célula.
Além da facilidade de uso, o poder do Cell Painting reside no grande volume de dados provenientes de um experimento. O banco de dados recém-lançado contém imagens de células respondendo a mais de 140.000 perturbações – seja um tratamento medicamentoso ou alguma outra modificação que aumente ou diminua a atividade de um gene. Usando esse conjunto de dados, Carpenter e alguns de seus colegas encontraram uma dúzia de compostos que parecem afetar as mesmas estruturas que são influenciadas por um gene chave envolvido em um câncer muscular de crescimento rápido. Em vez de colocar centenas de amostras em várias rodadas de experimentos em laboratório úmido, os pesquisadores de Broad criaram a lista de drogas há vários anos, digitando o nome do gene no banco de dados.
“É uma abordagem totalmente diferente que tem muito menos etapas e é muito menos dispendiosa”, diz TS Karin Eisinger, bióloga da Universidade da Pensilvânia que estuda esse tipo específico de câncer muscular. Sua equipe trabalhou com Carpenter para validar os compostos em testes de laboratório úmido, e os dois cientistas estão abrindo uma empresa para desenvolver ainda mais os candidatos mais promissores. Outros estão um pouco mais avançados: a Recursion Pharmaceuticals, uma empresa em Salt Lake City da qual Carpenter é consultor, já lançou cinco ensaios clínicos para testar candidatos a medicamentos identificados usando uma versão do Cell Painting.
Ao encerrar seu lançamento público, os membros do consórcio estão se preparando para trabalhar com o Health and Environmental Sciences Institute, com sede em Washington, DC, para ver se eles podem emparelhar os resultados da Cell Painting com outros dados para prever a toxicidade de produtos farmacêuticos e agroquímicos. .
Esther Landhuis é uma jornalista de ciência e saúde que mora na área da baía de São Francisco…
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